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檢測蛋白質(zhì)間相互作用的實(shí)驗(yàn)方法有哪些?
檢測蛋白質(zhì)間相互作用的實(shí)驗(yàn)方法有哪些?
1. 生化方法
●共純化、共沉淀,在不同基質(zhì)上進(jìn)行色譜層析
●蛋白質(zhì)親和色譜 基本原理是將一種蛋白質(zhì)固定于某種基質(zhì)上(如Sepharose),當(dāng)細(xì)胞抽提液經(jīng)過改基質(zhì)時(shí),可與改固定蛋白相互作用的配體蛋白被吸附,而沒有吸附的非目標(biāo)蛋白則隨洗脫液流出。被吸附的蛋白可以通過改變洗脫液或者洗脫條件而回收下來。
2. 等離子表面共振技術(shù)(Surface plasmon resonance)
該技術(shù)是將誘餌蛋白結(jié)合于葡聚糖表面,葡聚糖層固定于幾十納米厚的技術(shù)膜表面。當(dāng)有蛋白質(zhì)混合物經(jīng)過時(shí),如果有蛋白質(zhì)同“誘餌”蛋白發(fā)生相互作用,那么兩者的結(jié)合將使金屬膜表面的折射綠上升,從而導(dǎo)致共振角度的改變。而共振角度的改變與該處的蛋白質(zhì)濃度成線性關(guān)系,由此可以檢測蛋白質(zhì)之間的相互作用。該技術(shù)不需要標(biāo)記物和染料,安全靈敏快速,還可定量分析。
3. 遺傳學(xué)方法
使某處發(fā)生缺損,檢測對其他地方的影響。
●基因外抑制子?;蛲庖种谱邮峭ㄟ^一個(gè)基因的突變 來彌補(bǔ)原有基因的突變。比如相互作用的蛋白A和B,如果A發(fā)生了突變使兩者不再相互作用,此時(shí)B如果再發(fā)生彌補(bǔ)性突變就可以使兩者的相互作用恢復(fù),那么B就是A的基因外抑制子。
●合成致死篩選 指兩個(gè)基因同時(shí)發(fā)生突變會(huì)產(chǎn)生致死效應(yīng),而當(dāng)每個(gè)基因單獨(dú)發(fā)生突變時(shí)則無致死效應(yīng)。用于分析兩個(gè)具有相同重要蛋白之間的相互作用。
4. 雙雜交技術(shù)
原理基于真核細(xì)胞轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)構(gòu)特殊性,這些轉(zhuǎn)錄因子通常需要兩個(gè)或以上相互獨(dú)立的結(jié)構(gòu)域組成。分別使結(jié)合域和激活域同誘餌蛋白和獵物蛋白形成融合蛋白,在真核細(xì)胞中表達(dá),如果兩種蛋白可以發(fā)生相互作用,則可使結(jié)合域和激活域在空間上充分接近,從而激活報(bào)告基因。 缺點(diǎn):自身有轉(zhuǎn)錄功能的蛋白會(huì)造成假陽性。融合蛋白會(huì)影響蛋白的真實(shí)結(jié)構(gòu)和功能。不利于核外蛋白研究,會(huì)導(dǎo)致假隱性。
5. 熒光共振能量轉(zhuǎn)移技術(shù)
指兩個(gè)熒光法色基團(tuán)在足夠近(<100埃)時(shí),它們之間可發(fā)生能量轉(zhuǎn)移的現(xiàn)象。熒光共振能量轉(zhuǎn)移技術(shù)可以研究分子內(nèi)部對某些刺激發(fā)生的構(gòu)象變化,也能研究分子間的相互作用。它可以在活體中檢測,非常靈敏,分辯率高,能夠檢測大分子的構(gòu)象變化,能夠定性定量的檢測相互作用的強(qiáng)度。